La organización y funciones de las dependencias que integran la Universidad del Tolima, son establecidas en el acuerdo de estructura orgánica , en el manual de funciones y en los reglamentos internos:

Las dependencias del área académica se denominan: Vicerrectoría Académica,  Facultad, Programa, Instituto, Departamento y Centro.

Las dependencias del área administrativa se denominan: Vicerrectoría Administrativa, División, Sección y Grupo.

Las dependencias del área de bienestar universitario y recursos educativos se denominan: Vicerrectoria de Desarrollo Humano, Dirección, Sección y Grupo.

Los órganos de carácter decisorio son: el Consejo Superior Universitario, el Consejo Académico, la Rectoría y los Comités.

Las dependencias de carácter asesor se denominan Oficinas.

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Unidades Académicas

Vicerrectoría Académica

Facultades y Departamentos

      Facultad de Administración de Empresas

    Departamento de Administración, Mercadeo y Jurídicas

    Departamento de Economía y Finanzas

Facultad de Ciencias

    Departamento de Biología

    Departamento de Física

    Departamento de Matemáticas y Estadística

    Departamento de Química

Facultad de Ciencias de la Educación

    Departamento de Ciencias Sociales

    Departamento de Español-Inglés

    Departamento de Psicopedagogía

Facultad de Ciencias de la Salud

    Departamento de Ciencias Básicas de la Salud

    Departamento de Ciencias Clínicas

    Departamento de Salud Comunitaria

Facultad de Ingeniería Agronómica

    Departamento de Desarrollo Agrario

    Departamento de Producción y Sanidad Vegetal

    Departamento de Suelos y Aguas

Facultad de Ingeniería Forestal

    Departamento de Ciencias Forestales

    Departamento de Ingeniería

Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia

    Departamento de Producción Pecuaria

    Departamento de Sanidad Animal

Facultad de Tecnologías

    Departamento de Dibujo

    Departamento de Topografía

Institutos

Instituto de Educación a Distancia

Centros

Centro de Estudios Regionale

Museo Antropológico

Unidades Administrativas

Vicerrectoría Administrativa

Divisiones

División Contable Financiera

División Servicios Administrativos

División de Relaciones Laborales y Prestacionales

Unidades de Bienestar

Vicerrectoría de Desarrollo Humano

Direcciones

Biblioteca "Rafael Parga Cortés"

Bienestar Universitario

     Centro Cultural Universitario

Unidades de Dirección

Consejos

 Consejo Superior

 Consejo Académico

Rectoría

Secretaría General

Oficina de Desarrollo Institucional

Oficina de Control de Gestión

Oficina de Relaciones Internacionales

Asesoría Jurídica